autometa.common package

Subpackages

• autometa.common.external package
  • Submodules
  • autometa.common.external.bedtools module
  • autometa.common.external.bowtie module
  • autometa.common.external.diamond module
  • autometa.common.external.hmmscan module
  • autometa.common.external.hmmsearch module
  • autometa.common.external.prodigal module
  • autometa.common.external.samtools module
  • Module contents

Submodules

autometa.common.coverage module

autometa.common.exceptions module

autometa.common.kmers module

autometa.common.markers module

autometa.common.metagenome module

autometa.common.utilities module

Module contents