Autometa modules

• autometa package
  • Subpackages
    • autometa.binning package
      • Submodules
      • autometa.binning.large_data_mode module
      • autometa.binning.large_data_mode_loginfo module
      • autometa.binning.recursive_dbscan module
      • autometa.binning.summary module
      • autometa.binning.unclustered_recruitment module
      • autometa.binning.utilities module
      • Module contents
    • autometa.common package
      • Subpackages
      • Submodules
      • autometa.common.coverage module
      • autometa.common.exceptions module
      • autometa.common.kmers module
      • autometa.common.markers module
      • autometa.common.metagenome module
      • autometa.common.utilities module
      • Module contents
    • autometa.config package
      • Submodules
      • autometa.config.databases module
      • autometa.config.environ module
      • autometa.config.utilities module
      • Module contents
    • autometa.datasets package
      • Module contents
    • autometa.taxonomy package
      • Submodules
      • autometa.taxonomy.database module
      • autometa.taxonomy.gtdb module
      • autometa.taxonomy.lca module
      • autometa.taxonomy.majority_vote module
      • autometa.taxonomy.ncbi module
      • autometa.taxonomy.vote module
      • Module contents
    • autometa.validation package
      • Submodules
      • autometa.validation.assess_metagenome_deconvolution module
      • autometa.validation.benchmark module
      • autometa.validation.build_protein_marker_aln module
      • autometa.validation.calculate_f1_scores module
      • autometa.validation.cami module
      • autometa.validation.cluster_process module
      • autometa.validation.cluster_process_docker module
      • autometa.validation.cluster_taxonomy module
      • autometa.validation.compile_reference_training_table module
      • autometa.validation.confidence_vs_accuracy module
      • autometa.validation.datasets module
      • autometa.validation.download_random_bacterial_genomes module
      • autometa.validation.length_vs_accuracy module
      • autometa.validation.make_simulated_metagenome module
      • autometa.validation.make_simulated_metagenome_control_fasta module
      • autometa.validation.reference_genome_from_quast module
      • autometa.validation.show_clusters module
      • autometa.validation.summarize_f1_stats module
      • autometa.validation.tabulate_bins module
      • autometa.validation.tabulate_metaquast_alignments module
      • autometa.validation.vizualize_assembly_graph_by_bin module
      • Module contents
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